Zewnętrznie Audi A6 i S6 praktycznie niczym się nie różnią. Oba auta produkowane są w tym samym nadwoziu, które w przypadku S6 ozdobione jest jedynie dodatkowym emblematem na osłonie chłodnicy. Jednak w kwestii upchania są różnice i to dość znaczące. Audi S6 montowane jest na bazie modyfikacji A6 Quattro z napędem na wszystkie koła w maksymalnej konfiguracji. Atrakcją całej linii są silniki – na przykład ostatnia generacja może pochwalić się 4,0-litrową jednostką napędową, która rozwija 420 KM mocy. Dla silnika zmienił się i biegi S6: główne węzły zawieszenia są zastąpione przez lżejsze aluminium, z nim ustawić nawet bardziej sztywne niż duch bliski jej A6 sport. Jeszcze jedną charakterystyczną cechą S6 jest kompletny zestaw. Salony tej linii niezmiennie spotykają kierowców ze skórą i stylowymi drewnianymi lub metalowymi wstawkami. Zamiast standardowych foteli montowane są tu wygodne „kubełki” Recaro. Tradycyjnie dość obszerna lista elektroniki – oprócz standardowego wyposażenia S6 w ostatnich latach może pochwalić się obecnością czujnika ciśnienia w oponach, systemu śledzenia oznaczeń pasów ruchu, adaptacyjnego tempomatu, tylnego Parktronicu, czterostrefowej klimatyzacji i innych miłych gadżetów.
